红肉蜜柚系福建省农业科学院果树研究所，1998年在平和县小溪镇琯溪 蜜柚园中发现果实汁胞呈红色优良变异单株，1999年从母树上采撷接穗进行高接换种，和嫁接培育无性子l代苗木定植建立试验园；2001、2002年分别于秋季采撷子1代、子2代幼树当年生枝作为接穗，嫁接培育无性子2代、子3代苗木，同种于子1代试验园中。子1代高接树于2000年开始结果，苗木定植各子代相继于2003、2004、2005年开始挂果。从形态学、孢粉学、分子学等多方研究证实红肉蜜柚源自琯溪蜜柚芽变，且经多年多代区试观测结果表明，其表现丰产优质，成熟期早，汁胞红色等优良变异性状遗传稳定。2006年2月通过福建省非主要农作物品种认定委员会认定。认定证书号：闽认果2006006；2007年3月1日获国家农业部授予品种权保护，品种权号：CN20050515.7